Le programme régional donne la priorité au renforcement des stratégies et des initiatives existantes.

Sa pertinence est assurée par le fait qu’elle est pleinement alignée sur le Plan d’investissement pour l’Afrique avec des objectifs, des piliers, des théories du changement et un cadre de résultats communs, tout en étant pleinement alignée sur les priorités du continent. Avec le gouvernement, le programme travaillera avec l'Union africaine, avec les CER (via l'Union africaine) et avec les différents États membres au niveau national.

Le premier volet appuiera la réponse régionale globale visant à lutter contre la violence sexiste, les pratiques néfastes, la santé et les droits sexuels et reproductifs. Le deuxième volet répondra à la priorité que l’Union africaine s'est donnée de mettre fin aux mariages d’enfants et aux mutilations génitales féminines à travers le continent en soutenant les campagnes de l’Union africaine sur ces deux questions.

Le programme régional de l'Initiative Spotlight pour l’Afrique comprend des fonds pour le programme commun UNFPA-UNICEF sur les mutilations génitales féminines et le programme mondial UNFPA-UNICEF pour accélérer la lutte contre le mariage des enfants. Le programme régional appuiera également le renforcement des mouvements de femmes en Afrique en fournissant des fonds dédiés aux organisations de la société civile, notamment par l’intermédiaire du Fonds d’affectation spéciale des Nations Unies pour mettre fin à la violence à l’égard des femmes.

Le programme Afrique est en cours de développement, il devrait être lancé en 2019.